La UNINI actualmente tiene suscrito convenios de colaboración académica, científica y cultural con diversas universidades con el objetivo de lograr una mutua cooperación y fomentar la colaboración en varios programas de postgrado.

Dentro de las actuaciones está la de promover la participación de alumnos y profesores en programas a nivel de maestría y doctorado.

Fundación Universitaria Iberoamericana	Universidad de León (España)
Universidad Europea Miguel de Cervantes (España)	Instituto Politécnico Nacional (México)
Centro Panamericano de Estudios Superiores (México)	LEITAT, Technological Center (España)
Servicios Educativos UNINI S. A. (Bolivia)

Otras Colaboraciones

Red Educa PR Red social y educativa que promueve la integración de la tecnología y las herramientas de la web 2.0 en la educación.	Mujer Empresarial de Hoy Organización de servicios integrados para la transformación y desarrollo integral de la mujer.
Municipio de Barceloneta	Municipio de Arecibo
Cooperativa de Ahorro y Crédito en Lares - LarCoop	Puerto Rico Institute of Robotics